Cell | 成立人类树突状细胞与辅助性T细胞相互作用模型

巨噬细胞-巨噬细胞基本粒子持续性适合于，扩及大量化学键与波形渠道，学界钻研多年，仍旧是管中窥豹。来自巴黎PSL学术研究该大学的Vassili Soumelis团队于在Cell周刊上发表月出版A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的文章，创设了试验与论点紧密结合的学术研究作法，试验上，在蛋白水平都为品了巨噬细胞所分泌物的巨噬诱导与应激反应；论点上，创设了波形输入输出彼此之在在的紧密联系和基本粒子彼此在在。编者以生命大脑皮质柱状巨噬细胞（Dendritic cell，前身DC）与发挥起到T巨噬细胞（T Helper cell，前身Th）彼此之在在的基本粒子为学术研究取向，分析了36则有DC就其的波形化学键和17种Th分泌物的巨噬诱导，并依赖这些元数据创设数学模改进型，演算出56种仍未被试验声称的巨噬细胞相互彼此在在，与此同时，还推断出出290种可能彼此在在，并声称了IL-12p70可以通过IL-1波形渠道起到于17改进型发挥起到T巨噬细胞（前身Th17）。首先，编者收集了生命单核巨噬细胞来源的DC（MoDCs）和上皮细胞血液循环CD11c+DC（bDCs）两类巨噬细胞，并刺激24小时。所引入的刺激波形主要都有三大类多达14种。第一种：内源波形化学键，仅限于干扰素beta（interferon β，前身IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll都为诱导的丝氨酸，仅限于Toll4诱导的选择性脂多糖（ lipopolysaccharide，前身LPS），Toll1/2诱导选择性PAM3CSK4，Dectin1选择性Curdlan，Toll2/Dectin1选择性 zymosan，Toll7/8诱导选择性R848，Toll3诱导选择性 poly(I：C) 和NLRP3炎症小体活化剂铝钾；第三种：细菌病毒，仅限于高温灭活的Candida albicans （前身HKCA），莫扎特菌（Listeria monocytogenes，前身HKLM），Staphylococcus aureus （前身HKSA）， Streptococcus pneumoniae （前身HKSP）和乙型肝炎（influenza virus，前身flu）。最后，编者通过流式巨噬细胞术等作法，都为品了36种DC就其化学键的表述持续性，其中，29种处于巨噬细胞内层，7种处于巨噬上皮细胞物上清里头。结果显示，除了一些推断的DC巨噬细胞作出反应之外，编者还有了一些新的推测：（1）zymosan刺激的MoDCs 表述上佳的CD54 和PVR；（2）乙型肝炎刺激的MoDCs可以起到于ICOSL；（3）LPS刺激的MoDCs 可以起到于上佳的CD30L和CD83。再行慢慢地，编者将这些刺激过的DC与T巨噬细胞名教授6天，随后都为品Th的增殖效率以及17种Th就其巨噬诱导的表述分泌物持续性。有趣的是，编者将Th和DC的表现相互比较，推测，这二者彼此之在在并不存在双射的彼此在在，并不一定，两种刺激物对DC诱发的功效类似，但是，这两种刺激物所处理的DC与T巨噬细胞名教授之后，诱发的功效很可以截然不同。接着，编者引入生物接收者学的作法，以上述试验元数据创设模改进型。最简单来说，编者综合DC输出的36种波形化学键和Th输出的17种现像化学键，将两两彼此之在在的彼此在在简化为“可借依赖性”和“对人依赖性”两种，并且，还投身元数据库和已发表文献中的接收者，创设了适合于的波形依赖性的网络。则有如，通过这一模改进型，编者推测， IL-10的对人依赖性化学键仅限于OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而可借依赖性化学键仅限于Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这都为，赋予DC不同的刺激波形，编者就可以推断出Th作出反应巨噬细胞IL-10的表述分泌物持续性。最后，编者利用这都为模改进型，试图推断出并声称新的巨噬细胞相互彼此在在。通过创设的模改进型，编者推测，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2主导分泌物时，保守于依赖性IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 主导出现时，则更保守于依赖性IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的表述水平都显着降低。这些结果说明，IL-12作准备Th17的起到于并存。为了进一步探讨IL-12起到于Th17的机制，编者引入活体起到于Th的模改进型，推测，IL-12并无法直接起到于Th17，但是，同时投身IL-1和IL-12，Th17就起到于出来了。这是一篇试验与论点紧密结合的佳作。试验结果与计算建模相互支持，相互教导，相辅相成。如下图所示，试验大多引入了密不可分关连两大多元数据，一是何种刺激下DC巨噬细胞的作出反应，二是作出反应后的DC对T巨噬细胞的起到。论点大多以DC和T巨噬细胞的输出巨噬诱导为核心，创设了巨噬诱导彼此之在在的可借和对人依赖性的网络模改进型。通过这一模改进型，编者预测出一些新的巨噬细胞在在相互彼此在在，最终再行用试验声称这些彼此在在是否属实。这篇文章的令人难忘有两处，一是创设和试验论点紧密结合学术研究的除此以外，二是文章中提供的诸多巨噬细胞依赖性接收者以供学术研究概要。原始出处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.